10月4日,《PNAS》期刊在線發(fā)表吳東東課題組的最新研究成果“Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises”,該工作揭示了蜂猴適應(yīng)性進化的遺傳機制和群體歷史,被選為當期的封面文章。網(wǎng)頁鏈接:https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2123030119?
蜂猴是一類瀕危的靈長類動物,在進化過程中表現(xiàn)出許多不尋常的生理和行為特征,包括低代謝率、行動緩慢和夜行性等。蜂猴為雜食動物,主要以野果為食,也能以有毒昆蟲和樹膠為食物。為探究蜂猴適應(yīng)性進化的遺傳機制,吳東東團隊從頭組裝了倭蜂猴(Xanthonycticebus?pygmaeus)染色體水平的基因組序列,并對50只倭蜂猴和6只孟加拉蜂猴(Nycticebus bengalensis)進行全基因組重測序。研究發(fā)現(xiàn),與解毒有關(guān)的GSTA基因家族在蜂猴中特異性擴張,其在蜂猴肝臟中表現(xiàn)出特異性高表達。此外,研究人員發(fā)現(xiàn)PITRM1基因在蜂猴和考拉之間表現(xiàn)出趨同進化。功能實驗證明蜂猴PITRM1酶活性顯著降低,這可能導致了倭蜂猴低代謝率的特征。他們還在倭蜂猴中鑒定到與肌肉發(fā)育有關(guān)的正選擇基因MYOF,可能與其行動緩慢相關(guān)。相比較其它物種,倭蜂猴中正選擇基因PER2與晝夜節(jié)律核心蛋白CRY的結(jié)合能力更弱,這一發(fā)現(xiàn)可能與該物種不尋常的晝夜節(jié)律有關(guān)。最后,群體基因組學分析顯示,生活在同一地區(qū)的倭蜂猴和孟加拉蜂猴在過去100萬年的時間里,在有效群體大小動態(tài)變化上表現(xiàn)出了一種逆相關(guān)關(guān)系,這意味著兩個物種分化后存在物種間的競爭關(guān)系。?
吳東東研究員(昆明動物研究所)為本文的通訊作者。李明莉(昆明動物研究所),王勝(昆明動物研究所),許鵬輝(上海交通大學醫(yī)學院),田航宇(昆明動物研究所)為本文的共同第一作者。該項目得到了中國科學院戰(zhàn)略先導項目、國家自然科學基金項目、云南省基礎(chǔ)研究專項、中國科學院野生物種種質(zhì)庫動物分庫的支持。?
