2025年10月18日,在第四屆全國系統(tǒng)生物學大會“AI for Systems Health & Disease”特別主題日上,國家蛋白質科學研究(上海)設施(以下簡稱“蛋白質設施”)與上海臨床研究中心聯(lián)合實驗室正式揭牌成立。蛋白質設施主任吳家睿與上海臨床研究中心領導小組成員陳沅愷共同為聯(lián)合實驗室揭牌,并正式發(fā)布“Systems Health & Disease(SHD)系統(tǒng)健康與疾病數(shù)據(jù)庫”。

此次合作標志著蛋白質設施在推動系統(tǒng)生物學與臨床醫(yī)學深度融合方面邁出關鍵一步,為我國精準醫(yī)療與主動健康戰(zhàn)略注入新動能。聯(lián)合實驗室將依托蛋白質設施在蛋白質科學前沿技術平臺的研發(fā)優(yōu)勢,結合上海臨床研究中心的臨床資源與醫(yī)學實踐,構建“臨床驅動+大科學平臺+臨床應用”的全鏈條合作范式,聯(lián)合實驗室將面向全國醫(yī)療機構、科研團隊開放。
蛋白質設施副主任、聯(lián)合實驗室負責人曾嶸介紹,實驗室將以臨床問題為起點,利用蛋白質設施的高通量、高精度技術平臺,開展多中心組學數(shù)據(jù)采集、疾病生物標志物發(fā)現(xiàn)、藥物靶點驗證等研究,并推動成果向臨床診療轉化,并致力于培養(yǎng)具備系統(tǒng)生物學視野的臨床科研復合型人才。
基于蛋白質設施和上海臨床研究中心臨床系統(tǒng)生物學平臺的前期工作,聯(lián)合實驗室首次發(fā)布了Systems Health & Disease(SHD)數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫是基于系統(tǒng)生物學框架構建的大型人群多組學資源平臺,整合了蛋白質組、代謝組等多維數(shù)據(jù),匯聚社區(qū)人群、疾病隊列及臨床試驗等多源隊列資源。SHD數(shù)據(jù)庫旨在突破傳統(tǒng)單一層次、單一人群的數(shù)據(jù)局限,系統(tǒng)解析健康與疾病狀態(tài)的個性化分子網(wǎng)絡,為精準診療、藥物研發(fā)和健康管理提供數(shù)據(jù)支撐。
未來,SHD數(shù)據(jù)庫將持續(xù)擴展數(shù)據(jù)規(guī)模與覆蓋維度,并引入人工智能技術,實現(xiàn)多層次、跨尺度數(shù)據(jù)的智能整合與標準化分析。蛋白質設施將攜手臨床與研究伙伴,推動SHD數(shù)據(jù)庫向醫(yī)院、科研機構與創(chuàng)新企業(yè)開放,構建可持續(xù)、可迭代的數(shù)據(jù)賦能生態(tài)。
此次聯(lián)合實驗室的成立與SHD數(shù)據(jù)庫的發(fā)布是蛋白質設施踐行“大科學設施服務人民生命健康”使命的重要實踐。蛋白質設施將繼續(xù)發(fā)揮其在蛋白質科學研究與技術開發(fā)中的引領作用,推動系統(tǒng)生物學與臨床醫(yī)學的交叉融合,為我國生物醫(yī)學創(chuàng)新與健康事業(yè)發(fā)展貢獻力量。