4月20日,基于GPU的冷凍電鏡高分辨率結(jié)構(gòu)解析軟件應(yīng)用培訓(xùn)班在蛋白質(zhì)中心A樓報(bào)告廳成功舉行。培訓(xùn)班由中科院生化與細(xì)胞所國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·上海電鏡分析系統(tǒng)和上海承藍(lán)科技股份有限公司共同舉辦,蛋白質(zhì)中心叢堯研究員主持,承藍(lán)科技團(tuán)隊(duì)馬珊珊博士主講。參加本次培訓(xùn)的人員包括所內(nèi)外60余名師生和技術(shù)人員。
培訓(xùn)班為期半天,由三個(gè)部分組成,包括RELION2.0、cryo-SPARC設(shè)置以及參數(shù)配置介紹、推薦硬件架構(gòu)介紹。培訓(xùn)現(xiàn)場(chǎng)氣氛熱烈,學(xué)員和主講人積極互動(dòng)。通過(guò)本次培訓(xùn),學(xué)員們從理論層面對(duì)這兩款基于GPU的三維重構(gòu)軟件和硬件配置有了更深入的掌握,為以后提高電鏡數(shù)據(jù)處理的效率打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。學(xué)員們對(duì)培訓(xùn)內(nèi)容和結(jié)果均表示非常滿意。
RELION-2.0 和cryo-SPARC 是兩款強(qiáng)大的基于 GPU 的三維重構(gòu)軟件,兩者的運(yùn)行效率與所用硬件及參數(shù)設(shè)置有密切關(guān)系。在掌握了這兩款軟件的運(yùn)行規(guī)律后,確定最適硬件資源、最佳參數(shù)設(shè)置后,將極大的提高電鏡數(shù)據(jù)的處理效率。
馬珊珊博士講座
講座現(xiàn)場(chǎng)
培訓(xùn)人員合影
(上海設(shè)施提供)